原核基因组中除rRNA、tRNA基因有多个拷贝外,重复序列不多。哺乳动物基因组中则存在大量重复序列(repetitivesequences。
用复性动力学等实验表明有三类重复序列:①高度重复序列(highlyrepetitivesequences,这类序列一般较短,长10300bp,在哺乳类基因组中重复106次左右,占基因组DNA序列总量的1060#xFF05;,人的基因组中这类序列约占20#xFF05;,功能还不明了。
②中度重复序列(moderatelyrepetitivesequences,这类序列多数长100500bp,重复101105次,占基因组1040#xFF05;。
例如哺乳类中含量最多的一种称为Alu的序列,长约300bp,在哺乳类不同种属间相似,在基因组中重复3×105次,在人的基因组中约占7#xFF05;,功能也还不很清楚。
在人的基因组中18S/28SrRNA基因重复280次,5SrRNA基因重复2000次,tRNA基因重复1300次,5种组蛋白的基因串连成簇重复3040次,这些基因都可归入中度重复序列范围