做完肠镜后腹泻是可以吃药的,应该是由于不洁净饮食,受凉导致的肠道菌群失调,感染导致,可以服用调节肠道菌群的药物治疗,症状好转了就可以停药,要多喝水进行补液,如果症状持续不好转,可以做个腹部彩超和便常规看看有无其他细菌感染,然后对症下药。