奥硝唑的副作用有轻度胃不适、胃痛、口臭等。神经系统方面会出现头痛、嗜睡、眩晕、震颤、四肢麻木、痉挛和神经系统紊乱。
脑脊髓疾病、癫痫和各种器官硬化症患者一定要谨慎服用。部分患者还有皮疹或者是皮肤瘙痒等局部反应。