睾丸萎缩的原因有常见的有炎症,如各种原因的睾丸炎、睾丸结核,造成睾丸组织结构发生坏死而萎缩;睾丸外伤、手术原因以致神经、血管损伤,导致供血障碍等而发生萎缩。
有些药物的影响,可直接或间接影响睾丸的功能,日久可造成睾丸的萎缩。先天性睾丸发育异常,使睾丸内无间质细胞,不能分泌睾酮,导致萎缩。