肛瘘的主要症状是,肛门附近的外口不断有少量脓性分泌物排出,有时刺激皮肤引起瘙痒不适.当外口阻塞或假性愈合时,瘘管内脓液不能排出,局部又出现红肿,疼痛,形成脓肿;
直至脓肿破溃或切开引流后,症状消失.以上情况,可以反复出现.较大的瘘管常有粪便或气体从外口排出。