引起肠炎病因有:病毒性肠炎,病毒性肠炎见于犬瘟热病毒、犬细小病毒、犬猫冠状病毒等引起的肠炎。细菌性肠炎,细菌性肠炎见大肠杆菌、沙门菌、耶尔森菌、毛样产芽胞杆菌、空肠弯曲杆菌、梭菌、等引起的肠炎。
真菌性肠炎,真菌性肠炎见组织胞浆菌、藻状菌、曲霉菌、白念珠菌等引起的肠炎。饮食导致的肠炎,污染或腐败变质食物、刺激性化学物质、某些重金属中毒,以及某些变态反应等都能引起肠炎。