桥本氏甲亢发病主要与自身免疫有关,其他病变引起的甲亢在发病上各有特点或仍有不清之处。在体液免疫方面已知有多种抗甲状腺细胞成分的抗体,如针对受体的甲状腺刺激性抗体,它能与受体或其相关组织结合,加强甲状腺功能,这种抗体可通过胎盘组织,引起新生儿甲亢,或甲亢治疗后不彻底,抗体持续阳性,导致甲亢复发。