巧克力囊肿可以通过阴道后穹隆穿刺,抽出咖啡色或巧克力色浑浊液,甚至有血性液体。还可以进行B型超声检查,见附件区与子宫密切相连处有轮廓不规则囊腔,液性暗区中充满弥漫性杂乱细回声,或不均匀的片状回声,或直肠子宫陷凹有液性暗区。