由于细菌及分泌物积存于扁桃体窝导致的也可能继发于某些急性传染病如猩红热、白喉、流感、麻疹等。急性扁桃体炎主要是继发于上呼吸道感染可伴有不同程度的咽部的黏膜和淋巴组织的急性炎症。
慢性扁桃体炎因为细菌在人体抵抗力下降的时候就入侵扁桃体的声部,然后在局部繁殖继发感染造成慢性扁桃体炎的急性发作。