第一、角膜塑形镜会使角膜发炎、穿孔，导致眼睛失明。
最初的2-3年内，由于缺乏医疗管理和规范性操作，开展这项技术的医院等对角膜塑形术治疗近视了解不够深入，验配经验和技术非常有限，消费者的依从性差，媒体广告和产品推销商等的夸大宣传和误导，一些不具备资质的公司和眼镜店也纷纷开展，将角膜塑形镜当作普通商品出售，形成了良莠不齐的混乱局面，相关部门对角膜塑形镜的质量也未能严格监管，使得最初几年内角膜塑形技术在中国配戴者中出现了一些严重不良现象。所以现在在网上充斥的关于佩戴角膜塑形镜出现的不良反应，很多都是在那个阶段出现的而非现阶段。目前媒体上很少有报道关于佩戴角膜塑形镜出现严重不良情况的报道。合格的视光师严格验配+合格的镜片+合格的用户（患者）=安全又有效。
第二、剥夺氧气，导致干眼。国家目前规定，夜戴型的镜片DK值（透氧率）要在90以上，而现在角膜塑形镜的透氧率都在100以上，甚至达到140。干眼症的形成与自身体质及用眼习惯有关，而并非完全由戴塑形镜后形成的。在验配初期一般都会检查孩子是否有干眼症，如果患有严重的干眼症是不适合配的。我国大多数的近视青少年都有眼干及结膜炎的症状，只是在配镜之前我们没有定期做这方面的检查，所以不知道这些问题，而戴镜后因为要定期做复查，其间医生有可能提到孩子眼干等症状，所以很多家长以为是戴镜以后造成的，其实不是，那些没有戴塑形镜的孩子同样都会有这种问题。另外需要观察孩子平时的用眼量，尤其是中学和高中的孩子，几乎没有休息时间，不是在学校上课，就是在家里做作业，或者在补习班补课，睡眠时间严重不足，视疲劳现象很严重，这样会无形当中增加眼部负担，造成一些眼病的发生。
第三、角膜中心变薄。角膜中心变薄是圆锥角膜病的主要病因之一。我们正常角膜中央厚度在0.5mm左右，经过对过夜佩戴7年的患者观察发现，佩戴后角膜中央有轻度变薄0.009mm，但其差异均无统计学意义。另外在验配初期，会检查患者角膜厚度，如有圆锥角膜是不适合配的。
第四、角膜曲率变形，角膜中心变薄周边相对高出，出现不规则散光和不规则重影的表现。不规则重影无法治疗。角膜有一定弹性，在戴镜初期，因压力作用把角膜中央组织转移到周边，上皮细胞厚度变薄，宽度增加，从而达到提升裸眼视力的效果，但角膜上皮细胞的数量是不变的，容量和面积是恒定的。戴镜后检查的角膜参数和没戴镜之前的参数肯定是不一样的。角膜是可逆的，一般停戴一月左右角膜的形态又回到它最原始的形态
