扁平疣变成黑色,扁平疣长的时间长了颜色就会变深,但是它是病毒性皮肤问题,病毒还是存在,所以要及时治疗,可以根据病情采取冷冻,激光的方法治疗,另外可以根据病情使用抗病毒药物治疗,可以到正规医院皮肤科检查,在医生指导下进行治疗。