巧克力囊肿实际上是子宫内膜异位症的一种,如果囊肿不大,疼痛不明显,可以不要用药治疗,如果囊肿较大,或在疼痛明显可以采取囊肿穿刺抽液或者是直接手术治疗,囊肿穿刺一般用于未婚的,或者是已婚有生育要求的,囊肿中等大小的,可以在B超引导下穿刺,疼痛有一点,但可以忍受。