传染性软疣有自愈性,多数情况下6~9个月后皮损可自行消退,一般不留瘢痕。治疗首选刮除,以将皮损中的软疣小体完全挤出为目的,然后涂以碘酊,可有效去除皮损。
其他如冷冻治疗、外用酞丁胺软膏或西多福韦软膏等均有效。