处理流产的胎儿,主要取决于孕妇有没有传染性疾病以及本人的意愿,如果孕妇患有传染性疾病,流产的胎儿必须强制交给医院处理,通过医学焚烧来进行处理,以免家属带回去造成传染病的传播,如果孕妇没有传染病,是可以根据孕妇个人的意愿来进行处理。