胃肠道间质瘤占胃肠道恶性肿瘤的1~3%,估计年发病率约为1020/100万,多发于中老年患者,40岁以下患者少见,男女发病率无明显差异。
GIST大部分发生于胃(50~70%)和小肠(20~30%),结直肠约占10~20%,食道占0~6%,肠系膜、网膜及腹腔后罕见。
GIST病人2030%是恶性的,第一次就诊时约有11~47%已有转移,转移主要在肝和腹腔。