隐睾会导致睾丸温度增加,其睾丸的生精作用也就破坏,则会因隐睾的破坏而产生多种抗精子抗体进而影响生育能力。也会引起睾丸萎缩,睾丸为下降到阴囊内,生后2年内还只有轻度的组织改变,但在2~5岁以后就会导致睾丸发育不全或萎缩,两侧隐睾可使90%的病人出现不育。
更会增加患癌风险隐睾者阴囊出现肿瘤是较为正常人的20-50倍。