阴茎疣常无自觉症状,多发部位为冠状沟、龟头、包皮、包皮系带、尿道口、尿道内、阴茎体及根部等处。初期呈淡红色小鼓点,中期散布呈群集或乳头样、鸡冠状或菜花样突起,不易察觉,部分会有痒痛感。
直肠内尖锐湿疣会有疼痛感、大便带血。