少精子症的原因有内分泌因素,人体内分泌紊乱,特别是下丘脑、垂体、睾丸这个性腺轴,系统功能紊乱,导致的睾丸生精功能的障碍,就会表现为少精子,甚至于无精子症:感染因素,生殖系统的特异性的和非特异性的感染均可造成少精子症:遗传因素,一些缺陷也会造成少精子症。
染色体畸变对精子密度、活动率及形态均有严重影响。