溶酶体具有多种生理功能:原生动物借助溶酶体消化摄入的食物;真核细胞细胞器更新动物发育和变态过程中组织的退化(如蝌蚪尾部的吸收)就是由于溶酶体的活动所有白细胞均含有溶酶体性质的颗粒能消灭入侵的微生物溶酶体是由高尔基体断裂产生单层膜包裹的小泡数目可多可少大小也不等含有60多种能够水解多糖磷脂核酸和蛋白质的酸性酶这些酶有的是水溶性的有的则结合在膜上溶酶体的pH为5左右是其中酶促反应的最适pH 根据溶酶体处于完成其生理功能的不同阶段大致可分为:初级溶酶体次级溶酶体和残余小体 溶酶体的功能有二:一是与食物泡融合将细胞吞噬进的食物或致产等大颗粒物质消化成生物大分子残渣通过外排作用排出细胞;
二是在细胞分化过程中某些衰老细胞器和生物大分子等陷入溶酶体内并被消化掉这是机体自身重新组织的需要