亚急性甲状腺炎一般认为和病毒感染有关。发病前病人常有上呼吸道感染史,发病常随季节变动、且具有一定的流行性。病人血中常有病毒抗体存在,最常见的是柯萨奇病毒抗体,其次是腺病毒抗体、流感病毒抗体、腮腺炎病毒抗体等。