小的肝囊肿而又无症状者不需要特殊处理。大而出现症状者,应适当治疗,常用方法是在B超引导下肝囊肿穿刺抽液。肝囊肿切除适用于肝边缘部位,带蒂突向腹腔的肝囊肿。
肝左叶巨大肝囊肿可作甘叶或肝部分切除。多发性肝囊肿一般不主张手术治疗,仅在引起明显症状的大的肝囊肿作穿刺抽液,缓解症状。