甲真菌病的病因分为三大类:
一、皮肤癣菌的感染;
二、酵母菌的感染;
三、非皮肤癣菌的感染。有可能霉菌类的感染皮肤癣菌最多见,临床包括红色毛癣菌、须癣毛癣菌、和絮状毛癣菌等。酵母菌主要是念珠菌和马拉色菌,其他真菌包括柱顶霉孢霉和短帚霉等。