通常良性卵巢囊肿,可采用卵巢囊肿切除术,年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式,而尽可能保留正常的卵巢组织。或是输卵管卵巢切除术,年龄较大(45岁以上)或绝经后患者,可行行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。
而恶性卵巢囊肿,多数患者就诊时多已达晚期,因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶。