干扰素的不良反应会有恶心、呕吐、食欲缺乏、嗜睡、乏力、肌痛、关节痛、头痛,以及轻度脱发。局部用药可出现疼痛,偶见发红肿胀、色素沉着,注射部位可出现强烈疼痛、腹泻、腹痛、便秘、腹胀、肠蠕动增强、胃灼热等。