一旦发生了畸胎瘤,手术切除是唯一有效的根治方法。良性畸胎瘤通常手术切除即可痊愈。恶性畸胎瘤假如无法完全手术切除,有些可能需加上化疗后再进行手术切除。
由于极少数的良性畸胎瘤可能于日后发生恶变,所以畸胎瘤的质量应当尽早进行。