肉芽肿性前列腺炎的治疗应根据不同的病因选用药物、局部理疗或手术治疗。多数病例可只观察,无须处理而自愈,但结节的消失需数月至数年。
过敏性肉芽肿病需用类固醇激素治疗,Wegener综合征除需用类固醇激素治疗外,还需加用环磷酰胺治疗。对有哮喘或过敏者,尚需联用抗组胺药和对症治疗。
除非有严重的尿路梗阻,常不需手术治疗。