乙脑减毒活疫苗接种后不良反应有注射部位红肿、一过性发热、疼痛等，一般1～2天可自行缓解，偶可出现皮疹，无需特殊处理可自行消退。
极个别受种者会有视力减退、嗜酸粒细胞增多、肾小球性肾炎、血小板减少性紫癜等不良反应，还可能出现恶心、无力、呕吐、腹泻等全身性不良反应。
接种乙脑病毒活疫苗的不良反应较少，一般不需要就医治疗。如果有发热，可以用物理方法降温，如冰袋湿敷、用温毛巾擦拭全身帮助散热等；
如果出现局部红肿，可以进行热敷缓解肿胀。但是如果出现原因不明的疼痛（肌肉痛或皮肤痛）且持续时间较长或其他严重不良反应，应及时就医检查。
头晕和耳鸣的症状，这是属于美尼尔氏综合征的表现，应合理休息，避免过多活动，预防症状加重。
另外可以用一些营养神经药物治疗，比如维生素b1和甲钴胺等，同时可以用一些改善脑循环的药物比如洛伐他汀有助于缓解症状。另外如果确实症状严重，经过上面这些治疗以后无法改善，可以通过静脉输液治疗，也可以用甘露醇。还可以用小苏打，这样对于促进恢复有帮助。
美尼尔综合征目前没有能够完全治愈的方法，平时是容易出现反复发作。平时注意规律的生活，避免劳累和熬夜，养成良好的生活习惯，能够起到减少发作的频率。
自主神经是指调节内脏活动的神经组织，又称植物神经、内脏神经，是神经系统的重要组成部分，包括交感神经系统和副交感神经系统两部分。它们在大脑皮层和皮层下自主神经中枢的控制下，管理各种器官的平滑肌、心脏的，心肌，还有腺体及其它内脏器官的活动，调节机体新陈代谢的进行。自主神经系统具有与躯体神经不同的特点，如自主神经的传出神经主要支配心肌、血管、气管、胃肠道等的平滑肌及各种腺体，而躯体神经的传出神经主要支配骨骼肌；而且两种神经活动的表现不同。如躯体神经在支配躯体器官运动时，其支配目标、范围、活动方式、幅度、强度及持续时间等方面都能精确控制，而自主神经的支配效应是无法做到的，如人无法控制自己的心搏、胃肠蠕动，也无法控制出汗，在悲伤时无法让一只眼睛流泪而另一只不流泪等。
抗癫痫药物的副作用有胃肠道的不适，如恶心、呕吐，可出现头晕、头疼、嗜睡、视物双影、肢体活动的共济失调。抗癫药物的副作用还可以表现为血细胞的异常，如白细胞减少或血小板减少;还可以引起肝功能的损伤，如转氨酶的升高、碱性磷酸酶的升高等。因此，在应用抗癫痫药物时，要定期监测血常规及肝功。抗癫痫药物的不良反应还可以有过敏反应，如起皮疹，严重的过敏反应，可以发生表皮剥脱性皮炎。
