包括热水坐浴、通便、理疗,局部有急性炎症可用抗生素。该疗法只适用于反复发作的脓肿初期以及手术前准备,但不能彻底治愈。
如肛瘘为结核性,则按抗痨常规处理。单纯性肛瘘术前、后以口服灭滴灵、抗生素及其它辅助药物为主。复杂性肛瘘,体质衰弱病例,除应用抗生素外,尚应支持对症治疗。