你好,肛瘘手术三个月后伤口没有完全愈合可能是因为炎症,或者是排便不畅用力大便引起了伤口恢复不好。你的情况可以考虑去医院检查下,如果是伤口明显的红肿,那么要考虑及时消炎,注意平时采用高锰酸钾溶液等坐浴肛门