药物流产后两个星期了,如果小腹部有疼痛,那么考虑有可能是没有流干净,宫腔内有残留物刺激子宫收缩所致,建议您最好是去医院做妇科彩超,明确诊断后,积极治疗平时要注意休息,避免过度劳累,一个月内禁止同房及盆浴避免出现宫腔感染。