病人早期多无明显症状,该病一般病程较长,进展较为缓慢,一般无明显疼痛,病变肿物持续逐渐增大。随着肿物逐渐增大,表皮样囊肿可破裂,继发感染或者钙化。
肛周囊肿有明显症状时,其囊肿体积多较大,内容物为囊液,可达数百毫升。囊液以囊壁分泌物为主,多为红褐色,质地清稀,呈水样,伴细菌感染时呈黏稠脓液。