宫颈囊肿超过3cm要做手术。宫颈囊肿属于良性病变,多属于宫颈炎长期刺激引起的。如果囊肿超过3cm,在药物治疗下还是得不到控制或消退的,就应该尽早手术治疗,通常可以考虑光疗,激光,微波,自凝刀等物理治疗。