目前许多学者都认为绝大部分消化性溃疡之病因与幽门螺旋菌感染及止痛剂之使用有很大关系所以幽门螺旋菌之根除疗法理论上可以降低消化性溃疡之复发及再出血机会 ; 然而幽门螺旋菌与消化性溃疡致病机转之相关性尚待进一步研究 但是对於消化性溃疡已出血后之并发症并不因幽门螺旋菌治疗而减轻而幽门螺旋菌须根除之理由为90%的十二指肠性溃疡及70%左右的胃溃疡伴有幽门螺旋菌感染所以目前认为溃疡治疗合并幽门螺旋菌感染时除了使用胃酸抑制剂外尚需使用抗生素即根除疗法 然而那些病人需要积极治疗呢?
目前认为必须在胃镜下证实有消化性溃疡合并幽门螺旋菌感染才需考虑根除疗法而非症状上诊断或於单纯发生之溃疡当然在临床上治疗已发生之溃疡考虑使用胃酸抑制剂以便治疗溃疡之症状及减轻其合并症然而幽门螺旋菌确认诊断可经由病理组织学切片、血清学、碳十三尿素呼吸试验等来确认尤其於溃疡合并症之病人其幽门螺旋菌之根除疗法尤其重要因可避免溃疡复发及其所致之严重并发症况且确认幽门螺旋菌阴性后之溃疡者可能是导因於其他的胃肠疾病如胃泌细胞瘤( Zollinger-Ellison Syndrome、胃癌或长期使用止痛剂之病人确认幽门螺旋菌之感染有助於避免误诊及不必要之治疗副作用一般而言年轻人且无溃疡合并症经断断续续胃酸抑制剂后、尚有反覆发作症状明显者是最适合根除治疗者其余患者尚待临床进一步评估后使用当然治疗前必须先确定幽门螺旋菌感染以免除不适当治疗