造血干细胞移植的适应证包括恶性血液疾病,如急性髓细胞白血病、急性淋巴细胞白血病、慢性粒细胞白血病的进展期、慢性淋巴细胞白血病、骨髓增生异常综合征、多发性骨髓瘤、少见类型的白血病、霍奇金淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤;
非恶性疾病方面如先天性免疫缺陷病、先天性骨髓衰竭综合征、获得性再生障碍性贫血等。