目前小肠间质瘤的治疗方法主要是手术治疗和分子靶向治疗,而手术治疗目前是唯一有治愈可能的治疗手段.国内外学者研究发现,小肠间质瘤的首次治疗非常重要,假如采取合理的首次治疗,疗效将会明显的提高.不能首次完全切除的肿瘤来说,术前可采用辅助治疗措施(如服用分子靶向药物伊马替尼等),待瘤体缩小或肿瘤得到控制后再行手术切除,从而提高肿瘤的完整切除率。