原发性肺脓肿最常见感染的细菌包括需氧、厌氧和兼性厌氧菌。90%的患者合并有厌氧菌感染。一般患者仅形成单一的肺脓肿,但如形成多个,亦主要位于同侧肺脏。
如果感染系经血液到达肺部,则可形成多数散在的肺脓肿,这在使用不洁针头注射药物的瘾君子中最为常见。最后,大多数脓肿可溃破入气道,产生大量痰液而被咳出,在肺内留下充满液体和气体的空腔。
有时脓肿可溃破入胸腔,形成脓胸。大的脓肿可溃破入支气管,造成脓液扩散,引起肺炎和急性呼吸窘迫综合征。如果脓肿侵蚀血管壁,可发生严重的出血。