囊肿与脓肿的区别在于前者囊液由上皮组织产生,为无菌的,而后者是脓液包被形成,被认为是脏的。因为囊肿有上皮组织,所以囊肿手术需要彻底切除,如果遗留上皮组织容易导致复发;而脓肿可以穿刺抽液治疗,需要配合抗菌药物治疗。