胃肠道间质瘤(GastrointestinalStromalTumors、GISTs)是一类起源于胃肠道间叶组织的肿瘤、占消化道间叶肿瘤的大部分间质瘤作为一个较新的概念、应该涵盖了以前所谓的胃肠道平滑肌瘤或胃肠道平滑肌肉瘤恶性肿瘤胃癌起源于胃壁最表层的粘膜上皮细胞、可发生于胃的各个部位(胃窦幽门区最多、胃底贲门区次之、胃体部略少)、可侵犯胃壁的不同深度和广度癌灶局限在粘膜内或粘膜下层的称为早期胃癌、侵犯肌层以深或有转移到胃以外区域者称为进展期胃癌肉眼或胃镜观察胃癌有多种形态、如表浅型、肿块型、溃疡型、浸润型、溃疡癌(为慢性胃溃疡癌变)显微镜放大观察癌细胞有多种类型(组织学分类)、如腺癌(占约90%、包括乳头状腺癌、管状腺癌、粘液腺癌、印戒细胞癌)、腺鳞癌、鳞状细胞癌、未分化癌、类癌更细微的癌细胞内部的分子结构也有很多差异、因此、虽都称为胃癌、即使肉眼和显微镜下所见类型是相同的、但个性仍有很大差异、目前并不知晓究竟有多少个性独特的胃癌。
两种的区别在于间质瘤是一种在细胞间的肿瘤、而胃癌是在细胞的情况下引起的