气管管腔衬以粘膜,表面覆盖纤毛上皮,粘膜分泌的粘液可粘附吸入空气中的灰尘颗粒,纤毛不断向咽部摆动将粘液与灰尘排出,以净化吸入的气体 其结构与肠道上皮的杯状细胞相似,顶部胞质内含大量黏原颗粒,细胞分泌的黏蛋白是一种大分子糖蛋白,它与管壁内腺体的分泌物在上皮表面共同构成一道黏液性屏障,粘附吸入空气中的异物,溶解吸入的SO2、CO等有害气体,随黏液咳出。
基细胞呈锥形,位于上皮深部,是一种未分化的细胞,有增殖和分化能力,可分化形成前述两种细胞。