子宫内膜薄的原因主要是先天因素。宫腔有流产史的女性、容易造成宫腔粘连或子宫内膜的损伤:另外子宫内膜结核病毒易侵害生殖器官,造成子宫内膜结核侵蚀子宫内膜导致其逐渐变薄:再有就是节育环的频繁操作,会出现异味及取环等。
各种手术也会反复损伤子宫内膜导致其逐渐变薄。