克罗恩病的并发症很多,其中肠梗阻最常见,其次是腹腔内脓肿,偶可并发急性穿孔或大量便血,直肠或结肠粘膜受累者可发生癌变,肠外并发症有胆石症,系胆盐的肠内吸收障碍引起;
可有尿路结石等,建议结合症状体征给于对症用药。