丁肝HDV有两种基因组,分别是HDV和RNA。由1679~1683个核苷酸组成,形状为单链和环状,出此之外,还可以折叠成不分支的杆状结构。
完整的HDV颗粒呈直径35~37nm球形,内含HDVRNA及HDAg,其外壳为HBsAg。由HDV-RNA有9个编码区(ORF),ORF5可编码HDAg。
HDAg是一种能使机体诱生抗-HDIgM及抗-HDIgG的核蛋白。