前列腺囊肿是由于先天性或后天性的原因使腺体发生的囊样改变。大多数的前列腺囊肿是前列腺慢性炎症引起结缔组织增生,导致前列腺导管狭窄,分泌物潴留形成囊肿。
也可能由于寄生虫引起,如包虫能使前列腺管及周围发生慢性炎症,或由肉芽增生,逐渐形成囊肿。