巧克力囊肿的治疗费用是5千-9千元。费用受很多的因素影响。因为不同的医院有不同的收费标准,各地区经济发展层次不齐,治疗费用也会有一些差异,不同医生所采取的治疗方法不同,患者的个体差异,因此用药不同,药价不同,也会导致治疗费用不一样。