巧克力囊肿可以采用腹腔镜手术治疗治疗或药物治疗。腹腔镜手术治疗:只需要在患者腹部打开3个小孔,仅在腹腔部位留有几个线状疤痕,只有钥匙孔大小,可以说是创面小,痛楚小的手术;
药物治疗:抑制雌激素合成,使异位种植的子宫内膜萎缩,或切断下丘脑-垂体-卵巢轴的刺激和出血周期。