精子生成障碍遗传性疾病:常染色体或性染色体异常影响睾丸生成精子、如克氏(Klinefelter)综合征等。先天性睾丸异常:睾丸发育异常或睾丸位置异常均能使精子生成障碍。
睾丸本身病变:如睾丸外伤、炎症、扭转以及睾丸血管病变。内分泌疾病、垂体功能亢进或低下、垂体肿瘤、肾上腺功能亢进或低下、甲亢或甲低均可影响精子生成而造成无精子症。
严重全身性疾病和营养不良可致无精子症。