巧克力囊肿的临床诊断主要靠病史、症状和体征,常见的检查有:妇检、超声诊断、MRI、CT、腹腔镜及实验室检查,B超显象是目前辅助诊断子宫内膜异位症的有效方法,腹腔镜检查是目前诊断子宫内膜异位症的新标准,通过腹腔镜可直接窥视盆腔,见到异位病灶即可明确诊断,且可进行临床分期,以决定治疗方案。