龟头炎主要是通过临床表现,结合病原学和病理检查来确诊。如念珠菌感染引起者,病变部位取材直接镜检和培养可找到念珠菌;
阿米巴原虫引起者,取分泌物做涂片检查,可找到阿米巴原虫;浆细胞性龟头炎病理改变具有诊断价值。本病应与药物引起的固定性药疹等鉴别。