除了先天因素外,造成阴茎短小的后天原因主要有:睾丸萎缩,后天性的阴茎短小,主要是睾丸萎缩引起的;发育受阻;肾脏无能量;
疾病,隐睾、睾丸炎、睾丸发育不全等症状以及内分泌不平衡,雄性激素不足,导致阴茎短小。