百日咳具体危害有呼吸系统并发症:以气管炎、支气管肺炎最多见。多为继发感染,病原菌常为呼吸道的常见细菌,该并发症可发生于病程的各个时期,但以痉咳期为多。
严重的肺炎还可并发心力衰竭。除此以外,还常合并肺不张、肺气肿、支气管扩张、纵隔气肿。原有结核病患儿在患百日咳时,可激起重新活动或结核扩散,导致恶化。